Cuando se activa la función de copia de seguridad en las preferencias generales de OmniOutliner, se guarda una versión de copia de seguridad del esquema en la misma carpeta que el esquema principal. Si la aplicación se bloquea, se corta el suministro eléctrico u otros casos similares, la versión de copia de seguridad permanecerá en dicha carpeta con el nombre "[nombre de archivo] (guardado automáticamente).oo3". Cuando vuelva a abrir el documento, todas las copias de seguridad volverán a cargarse automáticamente.